あらすじ
あなたの扱うマイクロバイオームデータ，正しく取得，解釈できていますか？ 対象が複雑ゆえに多い研究の落とし穴を，“達人”たちが徹底フォローします．腸内細菌叢を軸に，真菌・ファージの解析や，皮膚・口腔などの微生物叢の解析まで網羅．実験の戦略や起こりうる問題への対処法を詳述し，ヒトのデータと結びつける方法も紹介しています．確かな知見を導き出すための必携書 【目次】 序 1章 マイクロバイオーム研究をはじめる前に考えること 1 ヒトマイクロバイオーム研究の全体像 2 データベースの意義とその整備 3 細菌の分類と命名 2章 腸内微生物叢のマイクロバイオームデータの生産 1 微生物叢DNAの抽出技術の開発状況および酵素法プロトコール 2 腸内細菌叢DNAの抽出技術（ビーズ法プロトコール）およびライブラリ調製 3 腸内細菌叢を対象とした16SrRNA遺伝子のアンプリコンとメタゲノムの情報解析 4 腸内常在性ファージの解析・宿主細菌との相互作用 5 腸内環境の代謝オミクス分析・解析 6 腸内真菌叢のマイクロバイオーム解析 3章 その他の微生物叢のマイクロバイオームデータの生産 1 皮膚細菌叢のマイクロバイオーム解析 2 唾液微生物叢のショットガンメタゲノム解析 3 ロングリードを用いたヒトマイクロバイオームの染色体外エレメントの解析 4 古代サンプルのマイクロバイオーム解析 4章 細菌株の性質の解析 1 菌株単離・培養と選定・釣菌，保存 5章 マイクロバイオームデータの関連解析 1 ヒト遺伝子一塩基多型（SNP）とマイクロバイオームの関連解析 2 環境因子（食事，生活習慣，薬剤）や疾患とヒトマイクロバイオームの関連解析 達人への一歩 1定期的な精度管理を，その1 2定期的な精度管理を，その2 3定期的な精度管理を，その3 4ウイルス（ファージ）叢の構成比について 5メタゲノムデータのなかから真核生物由来のDNAを検出する手法 6古代DNA解析への道のり
